Os principais objectivos do CBE são:

• Conjugar e coordenar esforços das diversas entidades privadas e organismos públicos no aproveitamento da biomassa;
• Apoiar técnica e tecnologicamente as empresas na produção de energia pela utilização da biomassa;
• Promover a transferência tecnológica de conhecimentos e tecnologias para as empresas industriais;
• Realizar e dinamizar trabalhos de demonstração, de investigação e desenvolvimento, visando novas tecnologias ligadas à produção, transformação e utilização da biomassa;
• Promover o desenvolvimento de equipamentos adequados à recolha, preparação, transformação e utilização da biomassa;
• Promover a formação técnica e tecnológica especializada, contribuindo para a formação de pessoal qualificado nas empresas e instituições, nos domínios relativos à sua finalidade;
• Divulgar informação técnica e tecnológica na área da sua especialização.